El Aeropuerto de Palma de Mallorca cuenta con las siguientes comisiones y grupos de trabajo:

Comisión de Seguimiento Ambiental. Creada mediante la resolución de 17 de febrero de 2011, de la Secretaría General de Medio Ambiente, por la que se modifica la de 20 de julio de 2004, por la que se formula la declaración de impacto ambiental sobre el proyecto de Ampliación el Aeropuerto de Palma de Mallorca. Esta comisión fue establecida para el seguimiento de las actuaciones del Plan de Aislamiento Acústico y de las obras recogidas en los proyectos evaluados en las distintas declaraciones de impacto ambiental (DIA).

Comisión Mixta para las Servidumbres Acústicas y el Plan de Acción del Aeropuerto de Palma de Mallorca. Instaurada mediante la Orden PRE/1925/2011, de 7 de julio, del Ministerio de la Presidencia, en aplicación de lo recogido en la Ley 5/2010 de Navegación. Esta Comisión informó previa y preceptivamente sobre el establecimiento de la servidumbre acústica y el plan de acción asociado, antes de su aprobación y, actualmente, debe velar por su cumplimiento.

Desde el Departamento de Medio Ambiente del Aeropuerto de Palma de Mallorca se llevan a cabo reuniones de seguimiento con Ayuntamientos y Asociaciones de Vecinos del entorno aeroportuario. En estas reuniones se tratan temas relacionados por la problemática generada por la afección acústica de la infraestructura aeroportuaria, como son: cierres de pista por obras, seguimiento del Plan de Aislamiento Acústico, análisis de las quejas recibidas, estudio de proyectos de mejora que implican cambios en la operativa del aeropuerto. Semanalmente se envían los cierres de pista previstos que pueden generar afección acústica sobre el entorno.